Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB3P05106 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB3P05106 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB3P05106 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB3P05106 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB3P05106 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB3P05106 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB3P05106 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGB3P05106 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB3P05106 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3P05106 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms