Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PCNTO95613 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCNTO95613 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCNTO95613 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCNTO95613 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCNTO95613 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCNTO95613 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCNTO95613 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCNTO95613 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCNTO95613 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCNTO95613 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCNTO95613 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCNTO95613 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCNTO95613 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCNTO95613 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCNTO95613 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCNTO95613 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCNTO95613 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCNTO95613 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCNTO95613 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCNTO95613 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCNTO95613 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PCNTO95613 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCNTO95613 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCNTO95613 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCNTO95613 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCNTO95613 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCNTO95613 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCNTO95613 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCNTO95613 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCNTO95613 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCNTO95613 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCNTO95613 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCNTO95613 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PCNTO95613 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PCNTO95613 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PCNTO95613 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PCNTO95613 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PCNTO95613 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PCNTO95613 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PCNTO95613 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PCNTO95613 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCNTO95613 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCNTO95613 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PCNTO95613 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCNTO95613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PCNTO95613 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCNTO95613 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PCNTO95613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PCNTO95613 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCNTO95613 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCNTO95613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCNTO95613 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PCNTO95613 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCNTO95613 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCNTO95613 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCNTO95613 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCNTO95613 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PCNTO95613 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCNTO95613 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCNTO95613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCNTO95613 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCNTO95613 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCNTO95613 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCNTO95613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCNTO95613 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PCNTO95613 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PCNTO95613 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCNTO95613 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCNTO95613 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCNTO95613 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCNTO95613 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCNTO95613 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCNTO95613 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCNTO95613 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCNTO95613 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCNTO95613 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCNTO95613 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCNTO95613 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PCNTO95613 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PCNTO95613 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PCNTO95613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PCNTO95613 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PCNTO95613 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCNTO95613 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCNTO95613 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PCNTO95613 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PCNTO95613 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PCNTO95613 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCNTO95613 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PCNTO95613 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCNTO95613 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PCNTO95613 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PCNTO95613 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PCNTO95613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCNTO95613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCNTO95613 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCNTO95613 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCNTO95613 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PCNTO95613 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms