Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDRT1O95170 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDRT1O95170 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDRT1O95170 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDRT1O95170 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDRT1O95170 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT1O95170 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDRT1O95170 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDRT1O95170 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms