Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALDH1A2O94788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A2O94788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A2O94788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A2O94788 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALDH1A2O94788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH1A2O94788 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH1A2O94788 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALDH1A2O94788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms