Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLQO75417 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLQO75417 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLQO75417 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLQO75417 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLQO75417 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLQO75417 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLQO75417 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLQO75417 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLQO75417 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLQO75417 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLQO75417 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLQO75417 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLQO75417 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLQO75417 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLQO75417 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLQO75417 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLQO75417 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLQO75417 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLQO75417 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLQO75417 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLQO75417 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLQO75417 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLQO75417 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLQO75417 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLQO75417 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLQO75417 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLQO75417 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLQO75417 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLQO75417 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLQO75417 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLQO75417 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLQO75417 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLQO75417 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLQO75417 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLQO75417 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLQO75417 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLQO75417 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLQO75417 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLQO75417 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLQO75417 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLQO75417 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLQO75417 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLQO75417 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLQO75417 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLQO75417 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLQO75417 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLQO75417 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLQO75417 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLQO75417 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLQO75417 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLQO75417 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLQO75417 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLQO75417 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLQO75417 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLQO75417 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLQO75417 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLQO75417 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLQO75417 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLQO75417 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLQO75417 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLQO75417 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLQO75417 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLQO75417 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLQO75417 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLQO75417 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLQO75417 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLQO75417 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLQO75417 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLQO75417 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLQO75417 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLQO75417 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLQO75417 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLQO75417 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLQO75417 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLQO75417 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLQO75417 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLQO75417 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLQO75417 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLQO75417 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLQO75417 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLQO75417 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLQO75417 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLQO75417 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLQO75417 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLQO75417 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLQO75417 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLQO75417 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLQO75417 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLQO75417 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLQO75417 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLQO75417 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLQO75417 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms