Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME2P1O60361 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NME2P1O60361 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME2P1O60361 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME2P1O60361 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME2P1O60361 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME2P1O60361 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME2P1O60361 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME2P1O60361 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME2P1O60361 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms