Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KIAA0556O60303 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
KIAA0556O60303 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
KIAA0556O60303 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KIAA0556O60303 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
KIAA0556O60303 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KIAA0556O60303 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
KIAA0556O60303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
KIAA0556O60303 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
KIAA0556O60303 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
KIAA0556O60303 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
KIAA0556O60303 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
KIAA0556O60303 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
KIAA0556O60303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KIAA0556O60303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
KIAA0556O60303 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
KIAA0556O60303 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
KIAA0556O60303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
KIAA0556O60303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
KIAA0556O60303 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
KIAA0556O60303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
KIAA0556O60303 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
KIAA0556O60303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
KIAA0556O60303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.74■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KIAA0556O60303 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
KIAA0556O60303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
KIAA0556O60303 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
KIAA0556O60303 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
KIAA0556O60303 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
KIAA0556O60303 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
KIAA0556O60303 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
KIAA0556O60303 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
KIAA0556O60303 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
KIAA0556O60303 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
KIAA0556O60303 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
KIAA0556O60303 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms