Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDIL3O43854 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDIL3O43854 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDIL3O43854 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDIL3O43854 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EDIL3O43854 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EDIL3O43854 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDIL3O43854 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EDIL3O43854 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDIL3O43854 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDIL3O43854 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
EDIL3O43854 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EDIL3O43854 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EDIL3O43854 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms