Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSNA1O43805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSNA1O43805 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSNA1O43805 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSNA1O43805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSNA1O43805 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms