Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR3O43761 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR3O43761 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGR3O43761 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR3O43761 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR3O43761 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGR3O43761 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms