Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD6O43541 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD6O43541 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD6O43541 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD6O43541 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD6O43541 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD6O43541 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD6O43541 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMAD6O43541 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD6O43541 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD6O43541 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD6O43541 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD6O43541 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMAD6O43541 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD6O43541 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD6O43541 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAD6O43541 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms