Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC5O15511 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARPC5O15511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARPC5O15511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARPC5O15511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARPC5O15511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC5O15511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms