Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN7O15265 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN7O15265 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN7O15265 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN7O15265 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN7O15265 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN7O15265 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN7O15265 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN7O15265 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN7O15265 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN7O15265 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN7O15265 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7O15265 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN7O15265 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN7O15265 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN7O15265 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN7O15265 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms