Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP17L12C9JPN9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L12C9JPN9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L12C9JPN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP17L12C9JPN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP17L12C9JPN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP17L12C9JPN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L12C9JPN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP17L12C9JPN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L12C9JPN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L12C9JPN9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L12C9JPN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP17L12C9JPN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP17L12C9JPN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
USP17L12C9JPN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP17L12C9JPN9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP17L12C9JPN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP17L12C9JPN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms