Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UMAD1C9J7I0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UMAD1C9J7I0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UMAD1C9J7I0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UMAD1C9J7I0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UMAD1C9J7I0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UMAD1C9J7I0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms