Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00587B1AMM8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00587B1AMM8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00587B1AMM8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00587B1AMM8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00587B1AMM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00587B1AMM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms