Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD3A6NKT7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD3A6NKT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD3A6NKT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD3A6NKT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD3A6NKT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD3A6NKT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD3A6NKT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD3A6NKT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RGPD3A6NKT7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD3A6NKT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD3A6NKT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RGPD3A6NKT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD3A6NKT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD3A6NKT7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RGPD3A6NKT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RGPD3A6NKT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD3A6NKT7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD3A6NKT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD3A6NKT7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RGPD3A6NKT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RGPD3A6NKT7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD3A6NKT7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RGPD3A6NKT7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RGPD3A6NKT7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD3A6NKT7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD3A6NKT7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD3A6NKT7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms