Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
STRCP1A6NGW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
STRCP1A6NGW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
STRCP1A6NGW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
STRCP1A6NGW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
STRCP1A6NGW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
STRCP1A6NGW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
STRCP1A6NGW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
STRCP1A6NGW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
STRCP1A6NGW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
STRCP1A6NGW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
STRCP1A6NGW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
STRCP1A6NGW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
STRCP1A6NGW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
STRCP1A6NGW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
STRCP1A6NGW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
STRCP1A6NGW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
STRCP1A6NGW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
STRCP1A6NGW2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
STRCP1A6NGW2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
STRCP1A6NGW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
STRCP1A6NGW2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
STRCP1A6NGW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
STRCP1A6NGW2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
STRCP1A6NGW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
STRCP1A6NGW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
STRCP1A6NGW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
STRCP1A6NGW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms