Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2BA6NFX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD2BA6NFX1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD2BA6NFX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2BA6NFX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2BA6NFX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD2BA6NFX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms