Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM30A4D0T7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM30A4D0T7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM30A4D0T7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM30A4D0T7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM30A4D0T7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM30A4D0T7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM30A4D0T7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM30A4D0T7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms