Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIPSLA2A3N6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIPSLA2A3N6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIPSLA2A3N6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIPSLA2A3N6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIPSLA2A3N6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIPSLA2A3N6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIPSLA2A3N6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIPSLA2A3N6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIPSLA2A3N6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIPSLA2A3N6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIPSLA2A3N6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms