Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN11A1L157 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSPAN11A1L157 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN11A1L157 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN11A1L157 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN11A1L157 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN11A1L157 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN11A1L157 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSPAN11A1L157 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN11A1L157 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms