Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POTEB3A0JP26 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POTEB3A0JP26 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POTEB3A0JP26 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POTEB3A0JP26 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POTEB3A0JP26 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POTEB3A0JP26 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POTEB3A0JP26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POTEB3A0JP26 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POTEB3A0JP26 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POTEB3A0JP26 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms