Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBA6A0AVT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBA6A0AVT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBA6A0AVT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBA6A0AVT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBA6A0AVT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBA6A0AVT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBA6A0AVT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBA6A0AVT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBA6A0AVT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBA6A0AVT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBA6A0AVT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms