Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LOC100506127A0A0U1RQW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LOC100506127A0A0U1RQW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LOC100506127A0A0U1RQW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LOC100506127A0A0U1RQW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LOC100506127A0A0U1RQW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOC100506127A0A0U1RQW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOC100506127A0A0U1RQW1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LOC100506127A0A0U1RQW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms