Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087WUV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087WUV0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A087WUV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087WUV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WUV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WUV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WUV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WUV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WUV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WUV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WUV0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WUV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WUV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WUV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A087WUV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WUV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WUV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WUV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WUV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WUV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WUV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WUV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087WUV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WUV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087WUV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms