Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8A1Q9Y2Q0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms