Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS2Q99743 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPAS2Q99743 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms