Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DFFAO00273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DFFAO00273 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DFFAO00273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DFFAO00273 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DFFAO00273 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DFFAO00273 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DFFAO00273 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms