Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
KRT28Q7Z3Y7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT28Q7Z3Y7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT28Q7Z3Y7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT28Q7Z3Y7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms