Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC9Q6ZRR7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms