Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CDC23-204ENST00000471692 1104 ntTSL 55.1□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 CDC23-203ENST00000464806 562 ntTSL 24.41□□□□□ -1.78e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 CDC23-205ENST00000475021 473 ntTSL 22.92□□□□□ -1.948e-9■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 ASB1-206ENST00000469885 743 ntTSL 320.16■□□□□ 0.824e-10■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 SHMT2-220ENST00000555634 964 ntTSL 510.13□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 40.9
SF3B4Q15427 NAT9-202ENST00000577428 555 ntTSL 418.05■□□□□ 0.481e-18■■■■■ 40.9
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SF3B4Q15427 NAT9-228ENST00000584409 545 ntTSL 315.7■□□□□ 0.11e-18■■■■■ 40.9
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SF3B4Q15427 NAT9-229ENST00000585240 554 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-18■■■■■ 40.9
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SF3B4Q15427 NAT9-214ENST00000581466 497 ntTSL 510.02□□□□□ -0.811e-18■■■■■ 40.9
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SF3B4Q15427 SLC2A4RG-206ENST00000491109 637 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-31■■■■■ 40.8
SF3B4Q15427 HSF4-207ENST00000519105 227 ntTSL 59.79□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 40.8
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SF3B4Q15427 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.721e-9■■■■■ 40.8
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SF3B4Q15427 DLEU2-206ENST00000449579 791 ntTSL 29.28□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 40.7
SF3B4Q15427 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 40.7
SF3B4Q15427 HSPD1-213ENST00000486181 648 ntTSL 23.86□□□□□ -1.793e-14■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 SLC2A9-209ENST00000506839 446 ntTSL 311.74□□□□□ -0.532e-26■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 MUM1-208ENST00000590695 2290 ntTSL 524.72■■□□□ 1.558e-19■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 MUM1-209ENST00000590866 1513 ntTSL 324.48■■□□□ 1.518e-19■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 MUM1-210ENST00000591337 1018 ntTSL 221.79■■□□□ 1.088e-19■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 MUM1-211ENST00000591433 2603 ntTSL 515.19■□□□□ 0.028e-19■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 MUM1-206ENST00000588810 867 ntTSL 59.67□□□□□ -0.868e-19■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 HBP1-207ENST00000468401 573 ntTSL 412.21□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-16■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 PABPC1L-212ENST00000479873 1178 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-16■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-204ENST00000460090 2273 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.625e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-205ENST00000511257 1735 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.885e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.265e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.35e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-206ENST00000512045 3926 ntTSL 56.78□□□□□ -1.325e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.45e-12■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 BUB1B-203ENST00000557848 633 ntTSL 34.38□□□□□ -1.717e-21■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 BUB1B-210ENST00000559772 560 ntTSL 42.23□□□□□ -2.057e-21■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 SNHG1-225ENST00000545920 625 ntTSL 26.14□□□□□ -1.436e-47■■■■■ 40.6
SF3B4Q15427 ROGDI-211ENST00000589543 713 ntTSL 515.34■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 RAB17-209ENST00000466244 937 ntTSL 213.61□□□□□ -0.237e-12■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 RECQL5-208ENST00000579265 333 ntTSL 27.64□□□□□ -1.197e-12■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 519.29■□□□□ 0.684e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-212ENST00000455608 648 ntTSL 318.66■□□□□ 0.584e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 214.57□□□□□ -0.084e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.134e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-10■■■■■ 40.5
SF3B4Q15427 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-10■■■■■ 40.5
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