RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455608.5

SMTN-212, Transcript of smoothelin, humanhuman

TSL 3

Gene SMTN, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-212ENST00000455608 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.7■■■■■ 5.55
SMTN-212ENST00000455608 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.02■■■■■ 4.64
SMTN-212ENST00000455608 ABCC9O60706 1549 aa42.45■■■■■ 4.39
SMTN-212ENST00000455608 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SMTN-212ENST00000455608 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.21■■■■■ 4.19
SMTN-212ENST00000455608 NACADO15069 1562 aa41.17■■■■■ 4.18
SMTN-212ENST00000455608 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.14■■■■■ 4.18
SMTN-212ENST00000455608 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.1■■■■■ 4.17
SMTN-212ENST00000455608 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
SMTN-212ENST00000455608 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.34■■■■■ 4.05
SMTN-212ENST00000455608 SCRIBQ14160 1630 aa40.21■■■■■ 4.03
SMTN-212ENST00000455608 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.88■■■■□ 3.97
SMTN-212ENST00000455608 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.953e-10■■■■□ 19.6
SMTN-212ENST00000455608 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.61■■■■□ 3.93
SMTN-212ENST00000455608 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
SMTN-212ENST00000455608 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
SMTN-212ENST00000455608 SMARCA4P51532 1647 aa38.5■■■■□ 3.75
SMTN-212ENST00000455608 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
SMTN-212ENST00000455608 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.47■■■■□ 3.75
SMTN-212ENST00000455608 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.38■■■■□ 3.73
SMTN-212ENST00000455608 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.34■■■■□ 3.73
SMTN-212ENST00000455608 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.09■■■■□ 3.69
SMTN-212ENST00000455608 SMARCA2P51531 1590 aa38.07■■■■□ 3.69
SMTN-212ENST00000455608 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.07■■■■□ 3.68
SMTN-212ENST00000455608 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
SMTN-212ENST00000455608 WIZO95785 1651 aa38.02■■■■□ 3.68
SMTN-212ENST00000455608 NCAPD3P42695 1498 aa37.94■■■■□ 3.66
SMTN-212ENST00000455608 HMGXB3Q12766 1538 aa37.87■■■■□ 3.65
SMTN-212ENST00000455608 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
SMTN-212ENST00000455608 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
SMTN-212ENST00000455608 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
SMTN-212ENST00000455608 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.12■■■■□ 3.53
SMTN-212ENST00000455608 NESP48681 1621 aa36.92■■■■□ 3.5
SMTN-212ENST00000455608 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.91■■■■□ 3.5
SMTN-212ENST00000455608 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.85■■■■□ 3.49
SMTN-212ENST00000455608 CFTRP13569 1480 aa36.78■■■■□ 3.48
SMTN-212ENST00000455608 PRDM2Q13029 1718 aa36.75■■■■□ 3.47
SMTN-212ENST00000455608 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.61■■■■□ 3.45
SMTN-212ENST00000455608 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.57■■■■□ 3.44
SMTN-212ENST00000455608 ERCC6Q03468 1493 aa36.51■■■■□ 3.44
SMTN-212ENST00000455608 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.47■■■■□ 3.43
SMTN-212ENST00000455608 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.38■■■■□ 3.41
SMTN-212ENST00000455608 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
SMTN-212ENST00000455608 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.21■■■■□ 3.39
SMTN-212ENST00000455608 WDR62O43379 1518 aa36.1■■■■□ 3.37
SMTN-212ENST00000455608 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
SMTN-212ENST00000455608 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.02■■■■□ 3.36
SMTN-212ENST00000455608 ABCC8Q09428 1581 aa36■■■■□ 3.35
SMTN-212ENST00000455608 TOPBP1Q92547 1522 aa35.98■■■■□ 3.35
SMTN-212ENST00000455608 CUX1P39880 1505 aa35.94■■■■□ 3.34
SMTN-212ENST00000455608 CUX2O14529 1486 aa35.92■■■■□ 3.34
SMTN-212ENST00000455608 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
SMTN-212ENST00000455608 SYNJ1O43426 1573 aa35.84■■■■□ 3.33
SMTN-212ENST00000455608 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.83■■■■□ 3.33
SMTN-212ENST00000455608 TOP2BQ02880 1626 aa35.79■■■■□ 3.32
SMTN-212ENST00000455608 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
SMTN-212ENST00000455608 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
SMTN-212ENST00000455608 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
SMTN-212ENST00000455608 IFT140Q96RY7 1462 aa35.57■■■■□ 3.28
SMTN-212ENST00000455608 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.54■■■■□ 3.28
SMTN-212ENST00000455608 SOGA1O94964 1423 aa35.52■■■■□ 3.28
SMTN-212ENST00000455608 WDR97A6NE52 1622 aa35.5■■■■□ 3.27
SMTN-212ENST00000455608 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SMTN-212ENST00000455608 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.37■■■■□ 3.25
SMTN-212ENST00000455608 TRIM41Q8WV44 630 aa35.37■■■■□ 3.25
SMTN-212ENST00000455608 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
SMTN-212ENST00000455608 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.34■■■■□ 3.25
SMTN-212ENST00000455608 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
SMTN-212ENST00000455608 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.25■■■■□ 3.23
SMTN-212ENST00000455608 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.235e-9■■■■□ 19.6
SMTN-212ENST00000455608 PBRM1Q86U86 1689 aa35.18■■■■□ 3.22
SMTN-212ENST00000455608 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.15■■■■□ 3.22
SMTN-212ENST00000455608 GRIN2BQ13224 1484 aa35.06■■■■□ 3.2
SMTN-212ENST00000455608 KIF27Q86VH2 1401 aa35.06■■■■□ 3.2
SMTN-212ENST00000455608 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.98■■■■□ 3.19
SMTN-212ENST00000455608 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.97■■■■□ 3.19
SMTN-212ENST00000455608 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.97■■■■□ 3.19
SMTN-212ENST00000455608 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
SMTN-212ENST00000455608 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
SMTN-212ENST00000455608 CHD1O14646 1710 aa34.86■■■■□ 3.17
SMTN-212ENST00000455608 IGF1RP08069 1367 aa34.83■■■■□ 3.17
SMTN-212ENST00000455608 CUL7Q14999 1698 aa34.82■■■■□ 3.17
SMTN-212ENST00000455608 SYNJ2O15056 1496 aa34.78■■■■□ 3.16
SMTN-212ENST00000455608 EEA1Q15075 1411 aa34.77■■■■□ 3.16
SMTN-212ENST00000455608 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.74■■■■□ 3.15
SMTN-212ENST00000455608 FBLN2P98095 1184 aa34.66■■■■□ 3.14
SMTN-212ENST00000455608 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SMTN-212ENST00000455608 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
SMTN-212ENST00000455608 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.64■■■■□ 3.14
SMTN-212ENST00000455608 GRIN2AQ12879 1464 aa34.63■■■■□ 3.13
SMTN-212ENST00000455608 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.61■■■■□ 3.13
SMTN-212ENST00000455608 PRXQ9BXM0 1461 aa34.55■■■■□ 3.12
SMTN-212ENST00000455608 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.53■■■■□ 3.12
SMTN-212ENST00000455608 CEP170Q5SW79 1584 aa34.49■■■■□ 3.11
SMTN-212ENST00000455608 OSCARQ8IYS5 282 aa34.47■■■■□ 3.11
SMTN-212ENST00000455608 KIF21BO75037 1637 aa34.46■■■■□ 3.11
SMTN-212ENST00000455608 NUP160Q12769 1436 aa34.44■■■■□ 3.1
SMTN-212ENST00000455608 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.4■■■■□ 3.1
SMTN-212ENST00000455608 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.33■■■■□ 3.09
SMTN-212ENST00000455608 GOLGA3Q08378 1498 aa34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms