RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583689.5

NAT9-223, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 2

Gene NAT9, Length 563 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-223	ENST00000583689	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.86	■■■■■ 4.45
NAT9-223	ENST00000583689	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.27	■■■■□ 3.72
NAT9-223	ENST00000583689	ABCC9	O60706	1549 aa		38.13	■■■■□ 3.69
NAT9-223	ENST00000583689	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.36	■■■■□ 3.41
NAT9-223	ENST00000583689	NACAD	O15069	1562 aa		36.12	■■■■□ 3.37
NAT9-223	ENST00000583689	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.02	■■■■□ 3.36
NAT9-223	ENST00000583689	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.72	■■■■□ 3.31
NAT9-223	ENST00000583689	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.63	■■■■□ 3.29
NAT9-223	ENST00000583689	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.62	■■■■□ 3.29
NAT9-223	ENST00000583689	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.53	■■■■□ 3.28
NAT9-223	ENST00000583689	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.52	■■■■□ 3.28
NAT9-223	ENST00000583689	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.42	■■■■□ 3.26
NAT9-223	ENST00000583689	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.25	■■■■□ 3.23
NAT9-223	ENST00000583689	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.91	■■■■□ 3.18
NAT9-223	ENST00000583689	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.81	■■■■□ 3.16
NAT9-223	ENST00000583689	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.44	■■■■□ 3.1
NAT9-223	ENST00000583689	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.4	■■■■□ 3.1
NAT9-223	ENST00000583689	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.33	■■■■□ 3.09
NAT9-223	ENST00000583689	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.35	■■■□□ 2.93
NAT9-223	ENST00000583689	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.33	■■■□□ 2.93
NAT9-223	ENST00000583689	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.26	■■■□□ 2.92
NAT9-223	ENST00000583689	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
NAT9-223	ENST00000583689	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NAT9-223	ENST00000583689	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NAT9-223	ENST00000583689	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NAT9-223	ENST00000583689	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NAT9-223	ENST00000583689	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
NAT9-223	ENST00000583689	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NAT9-223	ENST00000583689	CUX2	O14529	1486 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NAT9-223	ENST00000583689	NES	P48681	1621 aa		32.77	■■■□□ 2.84
NAT9-223	ENST00000583689	WIZ	O95785	1651 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NAT9-223	ENST00000583689	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NAT9-223	ENST00000583689	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NAT9-223	ENST00000583689	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
NAT9-223	ENST00000583689	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NAT9-223	ENST00000583689	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
NAT9-223	ENST00000583689	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.37	■■■□□ 2.77
NAT9-223	ENST00000583689	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.33	■■■□□ 2.77
NAT9-223	ENST00000583689	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
NAT9-223	ENST00000583689	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NAT9-223	ENST00000583689	CFTR	P13569	1480 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NAT9-223	ENST00000583689	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.01	■■■□□ 2.71
NAT9-223	ENST00000583689	WDR62	O43379	1518 aa		32	■■■□□ 2.71
NAT9-223	ENST00000583689	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.97	■■■□□ 2.71
NAT9-223	ENST00000583689	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NAT9-223	ENST00000583689	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NAT9-223	ENST00000583689	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
NAT9-223	ENST00000583689	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.39	■■■□□ 2.61
NAT9-223	ENST00000583689	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NAT9-223	ENST00000583689	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NAT9-223	ENST00000583689	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
NAT9-223	ENST00000583689	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.34	■■■□□ 2.61
NAT9-223	ENST00000583689	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.31	■■■□□ 2.6
NAT9-223	ENST00000583689	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.3	■■■□□ 2.6
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
NAT9-223	ENST00000583689	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
NAT9-223	ENST00000583689	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
NAT9-223	ENST00000583689	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
NAT9-223	ENST00000583689	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.02	■■■□□ 2.56	3e-7	■■□□□ 14
NAT9-223	ENST00000583689	CUX1	P39880	1505 aa		31.02	■■■□□ 2.56
NAT9-223	ENST00000583689	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.98	■■■□□ 2.55
NAT9-223	ENST00000583689	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.96	■■■□□ 2.55
NAT9-223	ENST00000583689	SOGA1	O94964	1423 aa		30.95	■■■□□ 2.54
NAT9-223	ENST00000583689	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.91	■■■□□ 2.54
NAT9-223	ENST00000583689	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.91	■■■□□ 2.54
NAT9-223	ENST00000583689	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.91	■■■□□ 2.54
NAT9-223	ENST00000583689	CHD1	O14646	1710 aa		30.89	■■■□□ 2.54
NAT9-223	ENST00000583689	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.87	■■■□□ 2.53
NAT9-223	ENST00000583689	FBLN2	P98095	1184 aa		30.85	■■■□□ 2.53
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.83	■■■□□ 2.53
NAT9-223	ENST00000583689	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.79	■■■□□ 2.52
NAT9-223	ENST00000583689	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.71	■■■□□ 2.51
NAT9-223	ENST00000583689	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.66	■■■□□ 2.5
NAT9-223	ENST00000583689	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.64	■■■□□ 2.5
NAT9-223	ENST00000583689	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.64	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.63	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.63	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.63	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.63	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.62	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.62	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.58	■■■□□ 2.49
NAT9-223	ENST00000583689	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.57	■■■□□ 2.48
NAT9-223	ENST00000583689	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.56	■■■□□ 2.48
NAT9-223	ENST00000583689	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.54	■■■□□ 2.48
NAT9-223	ENST00000583689	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.52	■■■□□ 2.48
NAT9-223	ENST00000583689	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.51	■■■□□ 2.47
NAT9-223	ENST00000583689	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.3	■■■□□ 2.44
NAT9-223	ENST00000583689	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.27	■■■□□ 2.44
NAT9-223	ENST00000583689	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.25	■■■□□ 2.43
NAT9-223	ENST00000583689	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.25	■■■□□ 2.43
NAT9-223	ENST00000583689	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.21	■■■□□ 2.43
NAT9-223	ENST00000583689	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.15	■■■□□ 2.42
NAT9-223	ENST00000583689	NUP160	Q12769	1436 aa		30.13	■■■□□ 2.41
NAT9-223	ENST00000583689	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.04	■■■□□ 2.4
NAT9-223	ENST00000583689	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.01	■■■□□ 2.39
NAT9-223	ENST00000583689	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30	■■■□□ 2.39
NAT9-223	ENST00000583689	IGF1R	P08069	1367 aa		29.97	■■■□□ 2.39
NAT9-223	ENST00000583689	CUL7	Q14999	1698 aa		29.89	■■■□□ 2.38
NAT9-223	ENST00000583689	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.87	■■■□□ 2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms