RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590866.2

MUM1-209, Transcript of melanoma associated antigen (mutated) 1, humanhuman

TSL 3

Gene MUM1, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUM1-209ENST00000590866 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.98■■■■■ 8.15
MUM1-209ENST00000590866 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.94■■■■■ 7.03
MUM1-209ENST00000590866 ABCC9O60706 1549 aa57.99■■■■■ 6.87
MUM1-209ENST00000590866 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.67■■■■■ 6.5
MUM1-209ENST00000590866 NACADO15069 1562 aa55.5■■■■■ 6.47
MUM1-209ENST00000590866 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.24■■■■■ 6.43
MUM1-209ENST00000590866 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.05■■■■■ 6.4
MUM1-209ENST00000590866 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.87■■■■■ 6.37
MUM1-209ENST00000590866 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.62■■■■■ 6.33
MUM1-209ENST00000590866 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.4■■■■■ 6.3
MUM1-209ENST00000590866 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.07■■■■■ 6.25
MUM1-209ENST00000590866 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.95■■■■■ 6.23
MUM1-209ENST00000590866 SCRIBQ14160 1630 aa53.65■■■■■ 6.18
MUM1-209ENST00000590866 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.58■■■■■ 6.17
MUM1-209ENST00000590866 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.45■■■■■ 6.15
MUM1-209ENST00000590866 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
MUM1-209ENST00000590866 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.48■■■■■ 5.99
MUM1-209ENST00000590866 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.19■■■■■ 5.94
MUM1-209ENST00000590866 SMARCA4P51532 1647 aa51.31■■■■■ 5.8
MUM1-209ENST00000590866 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.21■■■■■ 5.79
MUM1-209ENST00000590866 NCAPD3P42695 1498 aa51.19■■■■■ 5.79
MUM1-209ENST00000590866 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.12■■■■■ 5.77
MUM1-209ENST00000590866 SMARCA2P51531 1590 aa51.1■■■■■ 5.77
MUM1-209ENST00000590866 HMGXB3Q12766 1538 aa50.92■■■■■ 5.74
MUM1-209ENST00000590866 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.84■■■■■ 5.73
MUM1-209ENST00000590866 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.81■■■■■ 5.72
MUM1-209ENST00000590866 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
MUM1-209ENST00000590866 WIZO95785 1651 aa50.25■■■■■ 5.63
MUM1-209ENST00000590866 ERCC6Q03468 1493 aa50.07■■■■■ 5.61
MUM1-209ENST00000590866 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.06■■■■■ 5.6
MUM1-209ENST00000590866 NESP48681 1621 aa50.03■■■■■ 5.6
MUM1-209ENST00000590866 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.94■■■■■ 5.59
MUM1-209ENST00000590866 CUX2O14529 1486 aa49.74■■■■■ 5.55
MUM1-209ENST00000590866 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
MUM1-209ENST00000590866 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.66■■■■■ 5.54
MUM1-209ENST00000590866 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.61■■■■■ 5.53
MUM1-209ENST00000590866 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.49■■■■■ 5.51
MUM1-209ENST00000590866 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.51
MUM1-209ENST00000590866 CFTRP13569 1480 aa49.27■■■■■ 5.48
MUM1-209ENST00000590866 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.11■■■■■ 5.45
MUM1-209ENST00000590866 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.1■■■■■ 5.45
MUM1-209ENST00000590866 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.09■■■■■ 5.45
MUM1-209ENST00000590866 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.09■■■■■ 5.45
MUM1-209ENST00000590866 WDR62O43379 1518 aa48.97■■■■■ 5.43
MUM1-209ENST00000590866 PRDM2Q13029 1718 aa48.95■■■■■ 5.43
MUM1-209ENST00000590866 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.69■■■■■ 5.39
MUM1-209ENST00000590866 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
MUM1-209ENST00000590866 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
MUM1-209ENST00000590866 ABCC8Q09428 1581 aa48.29■■■■■ 5.32
MUM1-209ENST00000590866 TOPBP1Q92547 1522 aa48.25■■■■■ 5.31
MUM1-209ENST00000590866 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.18■■■■■ 5.3
MUM1-209ENST00000590866 IFT140Q96RY7 1462 aa48.09■■■■■ 5.29
MUM1-209ENST00000590866 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
MUM1-209ENST00000590866 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
MUM1-209ENST00000590866 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
MUM1-209ENST00000590866 CUX1P39880 1505 aa47.7■■■■■ 5.23
MUM1-209ENST00000590866 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
MUM1-209ENST00000590866 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.62■■■■■ 5.21
MUM1-209ENST00000590866 SOGA1O94964 1423 aa47.6■■■■■ 5.21
MUM1-209ENST00000590866 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.57■■■■■ 5.21
MUM1-209ENST00000590866 OSCARQ8IYS5 282 aa47.56■■■■■ 5.2
MUM1-209ENST00000590866 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.52■■■■■ 5.22e-16■■■■■ 52.7
MUM1-209ENST00000590866 WDR97A6NE52 1622 aa47.45■■■■■ 5.19
MUM1-209ENST00000590866 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
MUM1-209ENST00000590866 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.25■■■■■ 5.15
MUM1-209ENST00000590866 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.22■■■■■ 5.15
MUM1-209ENST00000590866 TOP2BQ02880 1626 aa47.21■■■■■ 5.15
MUM1-209ENST00000590866 CHD1O14646 1710 aa47.19■■■■■ 5.14
MUM1-209ENST00000590866 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.16■■■■■ 5.14
MUM1-209ENST00000590866 SYNJ1O43426 1573 aa47.13■■■■■ 5.14
MUM1-209ENST00000590866 GRIN2BQ13224 1484 aa47.13■■■■■ 5.13
MUM1-209ENST00000590866 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.1■■■■■ 5.13
MUM1-209ENST00000590866 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.07■■■■■ 5.13
MUM1-209ENST00000590866 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.06■■■■■ 5.12
MUM1-209ENST00000590866 FBLN2P98095 1184 aa47.05■■■■■ 5.12
MUM1-209ENST00000590866 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.02■■■■■ 5.12
MUM1-209ENST00000590866 PBRM1Q86U86 1689 aa47.02■■■■■ 5.12
MUM1-209ENST00000590866 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 SYNJ2O15056 1496 aa46.87■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 TRIM41Q8WV44 630 aa46.84■■■■■ 5.09
MUM1-209ENST00000590866 ARHGEF11O15085 1522 aa46.78■■■■■ 5.08
MUM1-209ENST00000590866 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.65■■■■■ 5.06
MUM1-209ENST00000590866 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
MUM1-209ENST00000590866 ADAMTS12P58397 1594 aa46.61■■■■■ 5.05
MUM1-209ENST00000590866 GRIN2AQ12879 1464 aa46.51■■■■■ 5.04
MUM1-209ENST00000590866 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.51■■■■■ 5.04
MUM1-209ENST00000590866 ARAP1Q96P48 1450 aa46.36■■■■■ 5.01
MUM1-209ENST00000590866 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.33■■■■■ 5.01
MUM1-209ENST00000590866 NUP160Q12769 1436 aa46.32■■■■■ 5.01
MUM1-209ENST00000590866 KIF27Q86VH2 1401 aa46.31■■■■■ 5
MUM1-209ENST00000590866 CEP170Q5SW79 1584 aa46.28■■■■■ 5
MUM1-209ENST00000590866 IGF1RP08069 1367 aa46.14■■■■■ 4.98
MUM1-209ENST00000590866 CUL7Q14999 1698 aa46.12■■■■■ 4.97
MUM1-209ENST00000590866 SHROOM2Q13796 1616 aa46.05■■■■■ 4.96
MUM1-209ENST00000590866 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.92■■■■■ 4.94
MUM1-209ENST00000590866 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.92■■■■■ 4.94
MUM1-209ENST00000590866 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.87■■■■■ 4.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms