RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463216.5

TTC3-212, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 842 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-212ENST00000463216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.89■■■■■ 7.18
TTC3-212ENST00000463216 ABCC9O60706 1549 aa53.67■■■■■ 6.18
TTC3-212ENST00000463216 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.64■■■■■ 6.18
TTC3-212ENST00000463216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.06■■■■■ 5.76
TTC3-212ENST00000463216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.77■■■■■ 5.72
TTC3-212ENST00000463216 NACADO15069 1562 aa50.69■■■■■ 5.71
TTC3-212ENST00000463216 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.17■■■■■ 5.62
TTC3-212ENST00000463216 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.04■■■■■ 5.6
TTC3-212ENST00000463216 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.94■■■■■ 5.58
TTC3-212ENST00000463216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.92■■■■■ 5.58
TTC3-212ENST00000463216 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
TTC3-212ENST00000463216 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.52■■■■■ 5.52
TTC3-212ENST00000463216 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.38■■■■■ 5.5
TTC3-212ENST00000463216 SCRIBQ14160 1630 aa49.04■■■■■ 5.44
TTC3-212ENST00000463216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.78■■■■■ 5.4
TTC3-212ENST00000463216 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.43■■■■■ 5.34
TTC3-212ENST00000463216 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
TTC3-212ENST00000463216 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.29■■■■■ 5.32
TTC3-212ENST00000463216 NCAPD3P42695 1498 aa46.77■■■■■ 5.08
TTC3-212ENST00000463216 SMARCA4P51532 1647 aa46.71■■■■■ 5.07
TTC3-212ENST00000463216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.7■■■■■ 5.07
TTC3-212ENST00000463216 SMARCA2P51531 1590 aa46.58■■■■■ 5.05
TTC3-212ENST00000463216 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
TTC3-212ENST00000463216 HMGXB3Q12766 1538 aa46.44■■■■■ 5.03
TTC3-212ENST00000463216 ERCC6Q03468 1493 aa46.35■■■■■ 5.01
TTC3-212ENST00000463216 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
TTC3-212ENST00000463216 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.18■■■■■ 4.98
TTC3-212ENST00000463216 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.15■■■■■ 4.98
TTC3-212ENST00000463216 NESP48681 1621 aa46.12■■■■■ 4.97
TTC3-212ENST00000463216 CUX2O14529 1486 aa46.08■■■■■ 4.97
TTC3-212ENST00000463216 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.95■■■■■ 4.95
TTC3-212ENST00000463216 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.75■■■■■ 4.91
TTC3-212ENST00000463216 WIZO95785 1651 aa45.69■■■■■ 4.9
TTC3-212ENST00000463216 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
TTC3-212ENST00000463216 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.52■■■■■ 4.88
TTC3-212ENST00000463216 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.52■■■■■ 4.88
TTC3-212ENST00000463216 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.43■■■■■ 4.86
TTC3-212ENST00000463216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
TTC3-212ENST00000463216 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.1■■■■■ 4.81
TTC3-212ENST00000463216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
TTC3-212ENST00000463216 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.98■■■■■ 4.79
TTC3-212ENST00000463216 WDR62O43379 1518 aa44.95■■■■■ 4.79
TTC3-212ENST00000463216 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.94■■■■■ 4.78
TTC3-212ENST00000463216 CFTRP13569 1480 aa44.9■■■■■ 4.78
TTC3-212ENST00000463216 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.57■■■■■ 4.73
TTC3-212ENST00000463216 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
TTC3-212ENST00000463216 PRDM2Q13029 1718 aa44.5■■■■■ 4.71
TTC3-212ENST00000463216 TRIM41Q8WV44 630 aa44.18■■■■■ 4.66
TTC3-212ENST00000463216 OSCARQ8IYS5 282 aa44.11■■■■■ 4.65
TTC3-212ENST00000463216 TOPBP1Q92547 1522 aa44.09■■■■■ 4.65
TTC3-212ENST00000463216 IFT140Q96RY7 1462 aa44.05■■■■■ 4.64
TTC3-212ENST00000463216 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
TTC3-212ENST00000463216 ABCC8Q09428 1581 aa43.97■■■■■ 4.63
TTC3-212ENST00000463216 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.92■■■■■ 4.62
TTC3-212ENST00000463216 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
TTC3-212ENST00000463216 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
TTC3-212ENST00000463216 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.64■■■■■ 4.582e-7■■■□□ 15.1
TTC3-212ENST00000463216 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
TTC3-212ENST00000463216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
TTC3-212ENST00000463216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.54■■■■■ 4.56
TTC3-212ENST00000463216 SOGA1O94964 1423 aa43.49■■■■■ 4.55
TTC3-212ENST00000463216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
TTC3-212ENST00000463216 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
TTC3-212ENST00000463216 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
TTC3-212ENST00000463216 FBLN2P98095 1184 aa43.47■■■■■ 4.55
TTC3-212ENST00000463216 CHD1O14646 1710 aa43.44■■■■■ 4.54
TTC3-212ENST00000463216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
TTC3-212ENST00000463216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.42■■■■■ 4.54
TTC3-212ENST00000463216 CUX1P39880 1505 aa43.38■■■■■ 4.53
TTC3-212ENST00000463216 ARHGEF11O15085 1522 aa43.35■■■■■ 4.53
TTC3-212ENST00000463216 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.19■■■■■ 4.51
TTC3-212ENST00000463216 WDR97A6NE52 1622 aa43.16■■■■■ 4.5
TTC3-212ENST00000463216 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.13■■■■■ 4.49
TTC3-212ENST00000463216 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
TTC3-212ENST00000463216 GRIN2BQ13224 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
TTC3-212ENST00000463216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
TTC3-212ENST00000463216 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.95■■■■■ 4.47
TTC3-212ENST00000463216 PBRM1Q86U86 1689 aa42.94■■■■■ 4.46
TTC3-212ENST00000463216 ARAP1Q96P48 1450 aa42.93■■■■■ 4.46
TTC3-212ENST00000463216 SYNJ1O43426 1573 aa42.9■■■■■ 4.46
TTC3-212ENST00000463216 SYNJ2O15056 1496 aa42.89■■■■■ 4.46
TTC3-212ENST00000463216 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.88■■■■■ 4.46
TTC3-212ENST00000463216 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.85■■■■■ 4.45
TTC3-212ENST00000463216 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.8■■■■■ 4.44
TTC3-212ENST00000463216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.44
TTC3-212ENST00000463216 TOP2BQ02880 1626 aa42.71■■■■■ 4.43
TTC3-212ENST00000463216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
TTC3-212ENST00000463216 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
TTC3-212ENST00000463216 GRIN2AQ12879 1464 aa42.5■■■■■ 4.39
TTC3-212ENST00000463216 ADAMTS12P58397 1594 aa42.49■■■■■ 4.39
TTC3-212ENST00000463216 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.39■■■■■ 4.38
TTC3-212ENST00000463216 CEP170Q5SW79 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
TTC3-212ENST00000463216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.35■■■■■ 4.37
TTC3-212ENST00000463216 NUP160Q12769 1436 aa42.31■■■■■ 4.36
TTC3-212ENST00000463216 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.27■■■■■ 4.36
TTC3-212ENST00000463216 SHROOM2Q13796 1616 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC3-212ENST00000463216 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
TTC3-212ENST00000463216 JPH4Q96JJ6 628 aa41.98■■■■■ 4.31
TTC3-212ENST00000463216 KIF27Q86VH2 1401 aa41.92■■■■■ 4.3
TTC3-212ENST00000463216 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.88■■■■■ 4.29
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