Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHBDD3Q9Y3P4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHBDD3Q9Y3P4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms