Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRP68Q9UHB9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRP68Q9UHB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms