Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.086e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.036e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.066e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 214.29□□□□□ -0.126e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 514.22□□□□□ -0.136e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 513.98□□□□□ -0.176e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.266e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 311.45□□□□□ -0.586e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-204ENST00000475947 598 ntTSL 210.95□□□□□ -0.666e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 410.95□□□□□ -0.666e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 410.84□□□□□ -0.676e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-221ENST00000580180 753 ntTSL 29.99□□□□□ -0.816e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -16e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.086e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 25.48□□□□□ -1.536e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 224.48■■□□□ 1.518e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.048e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.038e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.948e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 220.08■□□□□ 0.88e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.468e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.268e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.038e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.038e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.268e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.558e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.068e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.278e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-203ENST00000469605 799 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.478e-25■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-204ENST00000470961 572 ntTSL 211.91□□□□□ -0.58e-25■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.177e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.447e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.287e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 222.9■■□□□ 1.267e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 17e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.937e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 519.51■□□□□ 0.717e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 319.31■□□□□ 0.687e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 318.97■□□□□ 0.637e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.637e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.417e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 517.57■□□□□ 0.47e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.347e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.317e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.317e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.37e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-206ENST00000573236 704 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.37e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 516.57■□□□□ 0.247e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-203ENST00000571819 317 ntTSL 516.56■□□□□ 0.247e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 216.54■□□□□ 0.247e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-12■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.177e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 315.95■□□□□ 0.147e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PAM16-207ENST00000573450 579 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V1F-202ENST00000492758 711 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.433e-12■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.457e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-203ENST00000554074 445 ntTSL 37.31□□□□□ -1.247e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.494e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.494e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.434e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.261e-323■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.187e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.961e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.481e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.371e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.261e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.221e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MT2A-204ENST00000563985 688 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MT2A-203ENST00000562017 903 nt14.68□□□□□ -0.061e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL37-203ENST00000398219 868 ntTSL 314.45□□□□□ -0.11e-10■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-18■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-18■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.874e-29■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.362e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.42e-30■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 211.81□□□□□ -0.526e-7■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.932e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.83e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.83e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.793e-6■□□□□ 9.2
APOBEC3CQ9NRW3 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)25.28■■□□□ 1.643e-6■□□□□ 9.2
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