Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms