Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV1-8P0DP01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms