Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKBQ93100 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKBQ93100 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms