Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms