Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT12Q53H54 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRMT12Q53H54 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms