Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF9Q13886 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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