Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms