Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPB1P53618 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPB1P53618 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPB1P53618 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPB1P53618 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB1P53618 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB1P53618 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB1P53618 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPB1P53618 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB1P53618 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB1P53618 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB1P53618 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms