Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms