Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 510.96□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 223.35■■□□□ 1.339e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.099e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.939e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.659e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.69e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.549e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.449e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.429e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-207ENST00000435251 547 ntTSL 515.32■□□□□ 0.049e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.239e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 DTX2-217ENST00000467729 496 ntTSL 510.97□□□□□ -0.659e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.849e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 BRAF-205ENST00000497784 2336 ntTSL 59.24□□□□□ -0.939e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RAB8A-207ENST00000592971 300 ntTSL 20.05□□□□□ -2.49e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.929e-6■■■■■ 32.4
DKC1O60832 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.185e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-212ENST00000544738 956 ntTSL 518.17■□□□□ 0.55e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.185e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-209ENST00000542286 2767 ntTSL 215.68■□□□□ 0.15e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-210ENST00000543016 329 ntTSL 313.73□□□□□ -0.215e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-206ENST00000539934 2240 ntTSL 513.01□□□□□ -0.335e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC12.49□□□□□ -0.415e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 DDX55-208ENST00000541259 460 ntTSL 310.41□□□□□ -0.745e-33■■■■■ 32.3
DKC1O60832 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 SYN3-207ENST00000462268 488 ntTSL 39.93□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 428.76■■■□□ 2.194e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 228.76■■■□□ 2.194e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 328.71■■■□□ 2.194e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.874e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 426.59■■□□□ 1.854e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-204ENST00000439603 1873 ntTSL 1 (best)26.02■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.634e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NCOR1-206ENST00000411510 1883 ntTSL 1 (best)25.09■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NCOR1-211ENST00000460276 1848 ntTSL 225.05■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AC069368.1-201ENST00000502574 1178 ntTSL 224.69■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 324.55■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 PDE4A-205ENST00000586275 695 ntTSL 323.62■■□□□ 1.374e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 423.19■■□□□ 1.34e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.213e-9■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.183e-9■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NCOR1-221ENST00000582357 1877 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 PDE4A-206ENST00000589073 1703 ntTSL 521.86■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 14e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 421.2■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 220.6■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-202ENST00000504625 435 ntTSL 320.35■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NCOR1-209ENST00000436828 1969 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-203ENST00000562092 254 ntTSL 520.08■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 320.08■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-210ENST00000514523 563 ntTSL 419.98■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 419.9■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-9■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 219.75■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.753e-13■■■■■ 32.2
DKC1O60832 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 319.38■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 519.13■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.87■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-206ENST00000481285 2895 ntTSL 218.58■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-205ENST00000472173 2685 ntTSL 518.38■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-206ENST00000510400 576 ntTSL 418.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 418.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ERN1-204ENST00000583028 523 ntTSL 417.91■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 317.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-13■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 317.19■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 417■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 416.95■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 32.2
DKC1O60832 ERN1-207ENST00000584041 566 ntTSL 416.86■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 32.2
DKC1O60832 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 515.96■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 32.2
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