RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460276.5

NCOR1-211, Transcript of nuclear receptor corepressor 1, humanhuman

TSL 2

Gene NCOR1, Length 1,848 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1-211ENST00000460276 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.29■■■■■ 5.96
NCOR1-211ENST00000460276 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.88■■■■■ 4.93
NCOR1-211ENST00000460276 ABCC9O60706 1549 aa44.11■■■■■ 4.65
NCOR1-211ENST00000460276 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
NCOR1-211ENST00000460276 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.58■■■■■ 4.57
NCOR1-211ENST00000460276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.17■■■■■ 4.5
NCOR1-211ENST00000460276 NACADO15069 1562 aa42.91■■■■■ 4.46
NCOR1-211ENST00000460276 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.91■■■■■ 4.46
NCOR1-211ENST00000460276 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.73■■■■■ 4.43
NCOR1-211ENST00000460276 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.31■■■■■ 4.36
NCOR1-211ENST00000460276 SCRIBQ14160 1630 aa42.19■■■■■ 4.34
NCOR1-211ENST00000460276 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.83■■■■■ 4.29
NCOR1-211ENST00000460276 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
NCOR1-211ENST00000460276 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.43■■■■■ 4.22
NCOR1-211ENST00000460276 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.73■■■■■ 4.11
NCOR1-211ENST00000460276 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
NCOR1-211ENST00000460276 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.4■■■■■ 4.06
NCOR1-211ENST00000460276 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
NCOR1-211ENST00000460276 SMARCA4P51532 1647 aa40.34■■■■■ 4.05
NCOR1-211ENST00000460276 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
NCOR1-211ENST00000460276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
NCOR1-211ENST00000460276 WIZO95785 1651 aa40.04■■■■■ 4
NCOR1-211ENST00000460276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.86■■■■□ 3.97
NCOR1-211ENST00000460276 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.86■■■■□ 3.97
NCOR1-211ENST00000460276 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.83■■■■□ 3.97
NCOR1-211ENST00000460276 SMARCA2P51531 1590 aa39.8■■■■□ 3.96
NCOR1-211ENST00000460276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
NCOR1-211ENST00000460276 NCAPD3P42695 1498 aa39.61■■■■□ 3.93
NCOR1-211ENST00000460276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
NCOR1-211ENST00000460276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.51■■■■□ 3.92
NCOR1-211ENST00000460276 HMGXB3Q12766 1538 aa39.49■■■■□ 3.91
NCOR1-211ENST00000460276 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.19■■■■□ 3.86
NCOR1-211ENST00000460276 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.58■■■■□ 3.77
NCOR1-211ENST00000460276 CFTRP13569 1480 aa38.55■■■■□ 3.76
NCOR1-211ENST00000460276 NESP48681 1621 aa38.5■■■■□ 3.75
NCOR1-211ENST00000460276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.38■■■■□ 3.74
NCOR1-211ENST00000460276 PRDM2Q13029 1718 aa38.28■■■■□ 3.72
NCOR1-211ENST00000460276 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.21■■■■□ 3.71
NCOR1-211ENST00000460276 ABCC8Q09428 1581 aa38.18■■■■□ 3.7
NCOR1-211ENST00000460276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.17■■■■□ 3.7
NCOR1-211ENST00000460276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.14■■■■□ 3.7
NCOR1-211ENST00000460276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38■■■■□ 3.67
NCOR1-211ENST00000460276 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.99■■■■□ 3.67
NCOR1-211ENST00000460276 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.99■■■■□ 3.67
NCOR1-211ENST00000460276 TRIM41Q8WV44 630 aa37.98■■■■□ 3.67
NCOR1-211ENST00000460276 ERCC6Q03468 1493 aa37.89■■■■□ 3.66
NCOR1-211ENST00000460276 SYNJ1O43426 1573 aa37.85■■■■□ 3.65
NCOR1-211ENST00000460276 CUX1P39880 1505 aa37.81■■■■□ 3.64
NCOR1-211ENST00000460276 TOP2BQ02880 1626 aa37.73■■■■□ 3.63
NCOR1-211ENST00000460276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
NCOR1-211ENST00000460276 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.69■■■■□ 3.62
NCOR1-211ENST00000460276 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.68■■■■□ 3.62
NCOR1-211ENST00000460276 TOPBP1Q92547 1522 aa37.67■■■■□ 3.62
NCOR1-211ENST00000460276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.67■■■■□ 3.62
NCOR1-211ENST00000460276 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
NCOR1-211ENST00000460276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.52■■■■□ 3.6
NCOR1-211ENST00000460276 WDR62O43379 1518 aa37.49■■■■□ 3.59
NCOR1-211ENST00000460276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
NCOR1-211ENST00000460276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.33■■■■□ 3.57
NCOR1-211ENST00000460276 SOGA1O94964 1423 aa37.32■■■■□ 3.57
NCOR1-211ENST00000460276 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
NCOR1-211ENST00000460276 CUX2O14529 1486 aa37.23■■■■□ 3.55
NCOR1-211ENST00000460276 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.22■■■■□ 3.55
NCOR1-211ENST00000460276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.14■■■■□ 3.54
NCOR1-211ENST00000460276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
NCOR1-211ENST00000460276 IFT140Q96RY7 1462 aa37.1■■■■□ 3.53
NCOR1-211ENST00000460276 KIF27Q86VH2 1401 aa37.09■■■■□ 3.53
NCOR1-211ENST00000460276 WDR97A6NE52 1622 aa37.06■■■■□ 3.52
NCOR1-211ENST00000460276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
NCOR1-211ENST00000460276 EEA1Q15075 1411 aa37.03■■■■□ 3.52
NCOR1-211ENST00000460276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
NCOR1-211ENST00000460276 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.96■■■■□ 3.51
NCOR1-211ENST00000460276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.55e-8■■■□□ 17.4
NCOR1-211ENST00000460276 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.89■■■■□ 3.5
NCOR1-211ENST00000460276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.89■■■■□ 3.5
NCOR1-211ENST00000460276 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.88■■■■□ 3.49
NCOR1-211ENST00000460276 IGF1RP08069 1367 aa36.82■■■■□ 3.49
NCOR1-211ENST00000460276 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
NCOR1-211ENST00000460276 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.79■■■■□ 3.48
NCOR1-211ENST00000460276 PBRM1Q86U86 1689 aa36.72■■■■□ 3.47
NCOR1-211ENST00000460276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.7■■■■□ 3.47
NCOR1-211ENST00000460276 GRIN2BQ13224 1484 aa36.69■■■■□ 3.46
NCOR1-211ENST00000460276 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.64■■■■□ 3.46
NCOR1-211ENST00000460276 PRXQ9BXM0 1461 aa36.64■■■■□ 3.46
NCOR1-211ENST00000460276 KIF21BO75037 1637 aa36.59■■■■□ 3.45
NCOR1-211ENST00000460276 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.58■■■■□ 3.45
NCOR1-211ENST00000460276 CUL7Q14999 1698 aa36.57■■■■□ 3.45
NCOR1-211ENST00000460276 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.56■■■■□ 3.44
NCOR1-211ENST00000460276 GOLGA3Q08378 1498 aa36.53■■■■□ 3.44
NCOR1-211ENST00000460276 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
NCOR1-211ENST00000460276 ADAMTS12P58397 1594 aa36.47■■■■□ 3.43
NCOR1-211ENST00000460276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.46■■■■□ 3.43
NCOR1-211ENST00000460276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
NCOR1-211ENST00000460276 FBLN2P98095 1184 aa36.38■■■■□ 3.41
NCOR1-211ENST00000460276 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
NCOR1-211ENST00000460276 SYNJ2O15056 1496 aa36.32■■■■□ 3.41
NCOR1-211ENST00000460276 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.27■■■■□ 3.4
NCOR1-211ENST00000460276 GRIN2AQ12879 1464 aa36.25■■■■□ 3.39
NCOR1-211ENST00000460276 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
NCOR1-211ENST00000460276 CHD1O14646 1710 aa36.14■■■■□ 3.38
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